当連盟は障がい者の水泳・水中運動及びパラリンピックを始めとする水泳競技活動を通して、障がい者の社会参加活動を促進するとともに、障がい者自らも社会貢献活動を行い、障がい者の心身の健全な発達と活力ある日本社会の構築に寄与することを目的としています。
目的を達成するため、次の事業を行うこととしています
①障がい者の水泳・水中運動及び水泳競技の普及・発展事業
②障がい者の水泳教室及び水泳競技大会の開催事業
③障がい者の水泳に関する調査・研究事業
④障がい者の水泳指導者養成及び認定事業
⑤障がい者の国際水泳競技大会への代表選手選定・派遣事業
⑥障がい者のスポーツに関する広告・出版事業
⑦障がい者のスポーツに関する商品の販売事業
⑧パラリンピックアスリートによる社会貢献事業
当連盟は国の外郭団体である（公財）日本パラスポーツ協会や日本パラリンピック委員会の加盟団体であり、会員の会費に加え、国等の支援の基に成り立っている団体です。